Bà đã kết hôn với Ikemba Iweala, một bác sĩ phẫu thuật thần kinh ở Umuahia, Abia State, Nigeria. Họ có bốn người con, bao gồm tác gia Uzodinma Iweala.[52][53][54][55][56]

Trong chiến dịch tranh cử chức vụ Tổng giám đốc kế nhiệm của WTO, Okonjo-Iweala đã trở thành công dân Hoa Kỳ vào năm 2019 sau thời gian dài làm việc và học tập ở đó.[57] Với tình hình căng thẳng thương mại đang diễn ra giữa Trung Quốc và Hoa Kỳ, các nhà phân tích nhận xét thái độ của Trung Quốc đối với bà đang dần định hình.[58]